工程区属典型大陆性气候，其特点是干燥少雨，四季分明，冬、夏季漫长，春、秋季短暂，有春季升温快但不稳定，秋季降温迅速温差大，光照充足，风沙较大等特点。多年平均气温9-12℃，最高气温38-40℃，最低气温-30℃左右，7月份平均气温22.9-25.9℃,1月份平均气温-9.4℃—-12℃。多年平均降水量62.7-66mm，多年平均蒸发量1980-2010mm。经对已有水文资料的分析整理，得出开都河大山口站多年平均径流量11.77×108m3。自1995年有水文记载以来，博斯腾湖大湖最高水位1049.08m，湖面面积1002.4km2时，大湖容积为88×108m3。