隧道结构防水一般由喷射混凝土、全封闭柔性卷材防水层和二次衬砌结构自防水等组成。本线隧道二次衬砌混凝土采用防水混凝土，其抗渗等级不低于P8；拱墙设置ECB防水板加土工布，明洞外贴ECB防水卷材；环向施工缝设置中埋式止水带及遇水膨胀止水胶，纵向施工缝设置止水胶及外贴式止水带；变形缝填充聚苯乙烯硬质泡沫板并加设中埋钢边橡胶止水带、外贴式止水带。二次衬砌混凝土施工后，拱部进行回填填注浆。
拱墙每10m设1环φ50单壁打孔波纹管，两侧边墙设φ80单壁打孔波纹管透水管盲沟各1道，该盲沟通过三通接头与环向盲沟及边墙泄水孔连通。