隧道结构防水一般由喷射混凝土、全封闭柔性卷材防水层和二次衬砌结构自防水等组成。本线隧道二次衬砌混凝土采用防水混凝土，其抗渗等级不低于P12；拱墙设置EVA塑料防水板加无纺布；施工缝设置止水带，并涂刷混凝土界面剂；二次衬砌混凝土施工后，拱部进行充填注浆。
拱墙每5～8m设1环φ80打壁打孔波纹管，两侧边墙外侧泄水孔标高处设纵向贯通的直径φ100双壁打孔波纹管，透水管盲沟各1道，该盲沟通过三通接头与环向盲沟及边墙泄水孔连通。