沿线地下水主要有第四系孔隙潜水及基岩裂隙水。其中第四系孔隙潜水主要分布在沿线阶地和河漫滩中，以及沿线较大支流、支沟的冲洪积地层中，含水层一般为砂类土层和碎石类土层中。地下水一般在河谷附近埋深较浅，地下水一般埋深0.5～10.0m，主要受大气降水和地表水补给。基岩裂隙水主要分布在基岩的节理、裂隙中，遇到沟谷切割常会溢出地表形成泉水。各层水一般不能互相连通。基岩裂隙水主要受大气降水、地表水和第四系孔隙潜水补给。
本区的河流主要是悖牛川，及其一级支流乌拉素沟、东小河、蛮兔塔河、东沟门河、磨房沟、徐家沟、小河沟、杨家沟、老高川、上石拉沟等。悖牛川为常年流水，流量和水位受季节影响较大，雨季暴涨暴跌。水质良好，对普通混凝土一般无侵蚀性，第四系孔隙潜水和基岩裂隙水水质良好，对普通混凝土一般无侵蚀性。
