墩桩基础形式采用人工挖孔嵌岩桩，桩身基本全部在中风化岩层内，桩基进入中风化岩层处和桩底岩石单轴抗压强度不低于地勘报告中相应标高处岩石强度指标。承台（除陈家桥车站轴承台外）也按嵌岩考虑，设计要求承台采用原槽浇注混凝土。
大学城车站场地为砂质泥岩和砂岩，车站主体共设计22根桩基、11个两桩承台。桩基为2.0×2.0m矩形桩，桩长均为15m，承台尺寸为8.5 m ×3.5 m ×3.8 m。
陈家桥车站场地为砂质泥岩和砂岩，车站主体共设计22根桩基、11个两桩承台。桩基为2.0×2.0m矩形桩，桩长大部分为17m（轴桩长20m，轴桩长22m，轴桩长10m），承台尺寸为8.5 m ×3.5 m ×3.5 m（轴承台尺寸为8.5 m ×3.5 m ×2.5 m）。
