路基工程：线路经过湿陷性黄土地段，路基与桥台、路基与路堑、路基与横向结构物、路基与隧道过渡多，为了确保线路的平顺性、稳定性，湿陷性黄土压实与路基过渡段的沉降控制是工程技术难点。
桥梁工程：全桥共有桥梁94座，具有桩深、墩高、桥隧错落分布密集的特点，桥梁基础沉降控制、现浇梁的徐变控制、箱梁通过隧道运输是施工的难点。
隧道工程：全线隧道长度74590.7双延米，隧道总延长占线路总长的39.27%，隧道工程是全线的控制性工程，隧道穿越断层破碎带、膏溶角砾岩、黄土等不良地质，特别是膏角溶砾岩、黄土等不良地质，特别是膏溶角砾岩的施工，是本工程的施工重点和难点。
板式无碴轨道：全线共有47.483双线公里，且在长大隧道施工完成后进行，具有工期紧、质量要求高、施工场地窄的特点，是施工的重点难点之一。