隧道出口为重点工程（为全线25个重点工程之一）出口工区地处中低山区，相对高差约1000m，自然坡度30～50°，植被发育，大部分地段基岩裸露。地表岩溶较发育，1300m以上垂向岩溶发育，岩溶形态主要为岩溶漏斗及落水洞；900～1200m以水平及垂直岩溶兼之，以垂向为主，在斜坡及谷地坡脚见有少量水平溶洞，规模较小，洞口直径1～3m，深50～100m；800m以下以水平岩溶发育为主。
云雾山围岩主要为灰岩、白云质灰岩、泥灰岩、泥质白云岩、页岩、炭质灰岩等。隧道围岩有Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ级，主要以Ⅱ、Ⅲ级围岩为主。云雾山隧道区内有白果坝、大鱼泉、小鱼泉、恶水溪、洞湾5个暗河系统。云雾山隧道深部岩溶较发育。隧道正常涌水量预测为32655m3/d，最大涌水量为81777m3/d。
DK245+604~DK245+404段设计为帷幕注浆法施工。
