为防止锚体渗水，对锚体回填地面线以上50cm至锚碇周边封底范围内的表面设置一层防水层，防水层面积共计4475m2。原设计图纸中防水层的组成为：1：2.5水泥砂浆找平层、YN-地下建筑防水涂料层、粗网眼（2*2mm）麻片布、1：2.5水泥砂浆保护层。由于在实施过程中发现YN-地下建筑防水涂料层与水泥砂浆保护层结合不紧密，相继出现了松动脱落的现象。后来经咨询有关专家，拟采用如下：
内部YN-地下建筑防水涂料防水层、粗网眼（2*2mm）麻片布、外部环氧砂浆保护层（1cm厚）及浆砌红砖层组成。
考虑到锚碇防水层面积较大，当结构变形或温差变形时易形成开裂，故对防水层设置分隔缝，并嵌填密封材料，这样可避免或减少防水层形成裂缝，导致造成渗漏。按纵向和横向间距10 m及转角处设置分割缝，缝宽为20mm，用改性乳化沥青与麻丝填充。
