通海隧道进口段施工涌水量大，其中富含岩溶裂隙水、基岩裂隙水。DK27+060~DK31+902段日涌水量为10万m3左右，雨季最大日涌水量为15万m3左右。同时通海隧道进口段为反坡排水，洞口段400m（DK27+060~DK27+460）坡度为12‰，其余部分均为本隧道的最大坡度20.4‰，反坡排水增加了洞内施工排水的难度。隧道外与平坡路基连接，设计路基比原有地表低6m左右，隧道施工过程中，洞门口地表水有回灌隧道的现象。