农业综合开发土地治理项目工程分为水利工程、农业工程、田间道路工程、林业工程、科技推广和其他措施。
水利工程包括小型水库、拦河坝、桥、涵、闸、排灌站、机电井、开挖疏浚渠道、衬砌渠道、埋设管道、喷灌、微灌、小型蓄排水工程及输变电线路配套等。
农业工程包括土壤改良（含平田整地、秸秆还田等措施）、仓库、晒场、购置设备、购置农业机械等。
田间道路工程包括干道、支道等。
林业工程包括防护林、水土保持林、苗圃等。
科技推广包括技术培训、仪器设备、示范推广等。
其他措施包括项目管理费、工程管护费等。