工程签证是双方协商一致的结果，是双方法律行为；工程索赔仅是单方主张权利的表示，是单方行为。
工程签证涉及的利益已经确定，可直接作为工程结算的凭据；工程索赔涉及的利益尚待确定，是一种期待权益。
工程签证是工程施工过程中的例行工作，一般不依赖于证据；工程索赔要求未获确认的权利主张，必须依赖证据。